한방병원
한방병원에 수련의로 들어갈 경우 인턴 1년과 레지던트 3년을 거쳐 전문의가 됩니다.
현재 전국에는 경희의료원을 비롯하여 102개의 한방 병원이 있고, 병원의 수는 앞으로도 점차 늘어날 전망입니다.선발 방법은 각 병원마다 약간씩 다른데, 경희의료원의 경우 본과 성적 40%, 필기시험 40%, 면접 20%로 선발합니다.
여자와 군 TO, 그 외의 남자를 구별하여 뽑는데, 그 비율은 여자의 경우 그 해 졸업생의 여학생 비율과 같은 비율로 뽑고, 군TO는 현재 80병상 당 1명으로 정해져 있으나 아직 고정된 선발 방식은 아닙니다. 병원의 전문의 과정은 현재 한의계에서 찬반 양론이 첨예하게 대립하고 있습니다. 병원은 안정적이고 경력이 인정되며, 남자의 경우 군의관이나 공중보건의가 될 수 있다는 장점 때문에 졸업생 중 가장 많은 수가 지원하는 곳으로, 그 수가 점차 늘어나는 추세입니다.

한의원
병원에 들어가지 않고 바로 개업하거나 기존 한의원의 부원장이 되는 경우를 말합니다.
장점은 병원에 비해 자유롭다는 점입니다.임상을 통한 자유로운 연구가 가능하며, 추나와 약침 등의 새로운 진료 방식을 다양하게 도입할 수 있다는 장점이 있습니다.
또한 한의학에 대해 스스로 생각하고 고민하여 환자를 대할 수 있는 기회를 가질 수 있습니다.

기초학교실
한의학을 학문적으로 깊이 연구할 수 있는 길 중 하나가 한의대 내의 기초학교실에 조교로 남는 것입니다.
기초학교실에 남기 위해서는 무엇보다도 한의학에 대한 열정을 가지는 것이 가장 중요하겠지요. 현재의 한의계는 기초분야의 연구원이 너무나 부족한 것이 현실입니다. 열정 있는 많은 사람들의 관심이 필요합니다. 앞으로는 정부의 기초의학 발전정책에 따라 기초의학연구소 등에 5년간 근무하면 병역을 면제해 주는 제도가 추진 중입니다.

국립한의학연구원
한국한의학연구원은 우리나라 전통의학인 국가 한의학 연구개발의 허브로서 1994년에 설립된 정부 출연연구기관입니다. 우리 연구원은 지난 10여 년 동안 한의학의 과학화와 표준화를 위해 기초이론과 임상연구 분야에 대한 연구개발투자에 집중하고 있으며, 개발된 기술의 산업화와 세계화에 박차를 가하고 있습니다.
2004년 대덕연구개발특구에 둥지를 튼 후, 한국한의학연구원은 제2의 도약기를 맞고 있습니다. 특히 설립 후 10년 동안의 장기 정체기를 벗어나 최근 3년간 예산과 규모면에서 2-3배의 양적 성장을 달성하는 등 비약적인 발전을 이룩했습니다. 그에 따라 연구개발 성과도 가시화되고 있습니다.
한국한의학연구원은 21세기 융합기술의 시대를 맞아 다양한 기술의 창고인 대덕연구개발특구 정부출연연들을 비롯 11개 한의대, 대학, 산업계 등과의 협력을 통해 한의학과 IT(정보기술), BT(바이오 기술), NT(나노기술) 등과의 융합기술을 연구하며, 새로운 한의학 패러다임을 구축해 나가고 있습니다.
한국한의학연구원은 앞으로 새로운 예방의학 패러다임을 구축해, 국민보건의료와 국민 삶의 질을 향상시키도록 하고, 나아가 한국을 세계 미래의학의 중심 국가로 도약시키기 위해 지속적으로 매진할 계획입니다.
국립한의학연구원 홈페이지 www.kiom.re.kr

전공분야
대학원의 목표는 대학에서 배운 내용을 바탕으로 보다 심도 있는 학문적 연구와 교육을 함으로써 한의학의 수준을 더욱 제고시키는 데에 있습니다. 대학원에서의 학습은 대학을 졸업하고나서 이루어지며, 임상 진료 등의 다른 일을 하면서도 병행할 수 있습니다.

기 초: 원전학, 의사학, 생리학, 병리학, 경혈학, 본초학, 처방방제형학, 예방의학, 해부학, 약리학, 생화학, 융합한의과학
임 상: 내과학(간계,심계,비계,폐계,신계), 부인과학, 소아과학, 안이비인후피부과학, 사상체질의학, 침구과학, 한방재활의학, 신경정신과, 진단생기능의학, 임상종양학, 한의학임상연구학
- 각 과의 자세한 내용은 기초학 / 임상학교실 소개를 참고하면 됩니다.

입학방법
석사과정
1. 국내외 대학의 학사 학위 소지자
2. 선발방법
① 학사성적과 면접성적 합산
② 구술면접 실시

박사과정
1.국내외 대학의 석사학위 소지자
2.선발방법
 ① 학사, 석사 성적과 면접성적 합산② 구술면접 실시

한의대생의 군입대는 크게 군의관, 공중보건의, 현역병, 공익근무요원이 있습니다.
첫째로 현역병은 누구나 알듯이 신체검사에서 1급에서 3급까지 받은 사람의 경우로 현역병으로 군대에 입대하여 국방의 의무를 다하는 것입니다. 그리고 공익근무요원은 4급을 받은 사람들로 과거의 방위제도와 비슷합니다. 다음으로 한의군의관과 공중보건의가 있습니다.
의사나 치과의사 대부분이 이 형태로 군대로 가는 데 반하여 한의사의 경우 현재는 그 인원이 제한되어 있습니다. 그 이유는 과거 군대에서 필요로 하는 치료가 한의학적인 것보다 양의학적 성격이 강했기 때문입니다. 현재는 지난 1996년 11월 11일 개정된 한의사의 전공의 수련에 관한 규정과 병역법에 의해 실행되고 있습니다. 다시 말해서 의사, 치과의사는 자격증만 있으면 군의관이나 공중 보건 의사가 될 수 있으나 한의사의 경우는 전문의 수련기관(대형한방병원)에서 수련을 받거나적어도 수련 중에 있어야 한다는 것입니다. 즉 군의관이 되려면 현역 입영대상자로서 한의사 자격증을 따고 한방 병원에서 인턴, 레지던트와 같은 전문의 수련 과정을 이수하거나 이수 중에 있어야 하는 것입니다.
공중 보건의도 마찬가지로 자격증과 전문의 수련과정을 이수하거나 이수 중에 있어야 합니다. 현재 한의사 공중 보건의는 60명, 한의사 군의관은 20명이며, 경희의료원에서는 매년 13명이 선발됩니다.

 병역법 제58조(의무, 법무, 군종, 장교 등에 편입)

1.	병무청장은 의사, 치과의사 또는 한의사의 자격이 있는 사람으로소 다음 각 호의 1에 해 당하는 사람에 대하여 원에 의하여 공중보건의사, 징병전담의사(한의사의 자격이 있는 사람을 제외한다. 이하 같다) 또는 국제협력의사로 편입할 수 있다. 이 경우 현역병입영대상자는 보충역에 편입한다.
	(1) 현역병입대상자로서 제58조제1항제1호의 규정에 의한 의무분야 현역장교의 병적에의 편입을 지원한 사람 중 그 편입이 되지 아니한 사람
	(2) 제58조제2항2제1호의 규정에 의한 의무사관후보생의 병적에 편입된 사람으로서 의무분야 현역장교병적에 편입되지 아니한 사람
	(3) 의사, 치과의사 또는 한의사의 자격이 있는 사람으로서 2제26조2제1항제1호의 규정에 의한 공익근무요원소집대상인 보충역인 사람
2.	제1항의 규정에 의하여 공중보건의사, 징병전담의사 또는 국제협력의사에 편입된 사람은 해당분야에 3년간 종사하여야 하며, 그 기간을 마친 때에는 공익근무요원의 복무를 마친 것으로 본다.
3.	제1항의 규정에 의하여 공중보건의사, 징병전담의사 또는 국제협력의사에 편입된 사람에 대하여는 제55조의 규정에 의한 교육소집을 실시하되, 그 교육기간은 복무기간에 산입하지 아니한다.
4.	공중보건의사, 징병전담의사 또는 국제협력의사의 편입,복무등에 관하여 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

앞에서 말한 것은 졸업 후의 일반적인 진로입니다.
그렇지만 그 외에도 제약회사의 연구소에 들어가거나, 보건의료 대학원에 입학하거나, 해외로 유학을 가는 등의 길이 있습니다. 본교는 해외에 자매결연을 맺은 학교가 많아 유학에 유리한 편입니다
또, 보건복지부등 정부기관에 들어가서 한방 정책과 행정에 관한 일을 할 수도 있습니다